거듭 증축은 미로처럼 뒤얽힌 사립 마코토 교 학원.
중등부 한해 신야貞一(에 아니 사다 카즈)는 어느 날 구교에서 방황 우연히 간신히 도착한 방에서 이상한 분위기를 휘감는 소녀庚유코 (庚유코)와 만난다.
그녀는 자신을 '구교의 유령 "이라고 말한다.
자신의 과거를 기억하지 못하신 유코 때문에,貞一와 유코는 "괴이 조사부"를 설립,이 학원에서 구전되는 수많은 괴이한을 풀어 간다.