평범한 고교생 사카이 유지의 일상은 어느날 돌연 소멸한다.

이계에서 건너 온 '사람의 존재를 빨간색으로 바꾸고 잡아먹는 괴물 홍세의 무리'에게 당한 유지는 망연자실한 채 있다.
그런 그를 구한 것은 빨간 머리와 눈을 가진 의문의 소녀였다.
그리고 그 소녀는 유지에게 말한다.

'넌 이미 존재하지 않아'라고...

샤나라는 그 소녀는 '토치(망자)가 된 그의 안에 깃든 보구를 감시하기 위해 온자키시에 머무르게 된다.
그리고 둘은 그를 토치로 바꾼 원흉, 그 마을에 잠입한 홍세의 왕 헌터 프리아그네와 대결한다.