초등학교 5학년 소년 하야스기 하야토는 겨울 방학 숙제를 약속대로 끝낸 포상에 아버지하야스기 호쿠토에 이끌려 도호쿠 신칸센 'E5 계 매'에 태워달라고 약속을 했다.하야토는 신칸센을 사랑하고 미래의 꿈은 신칸센의 운전 기사가되는 것.평소 바쁜 아버지 · 호쿠토와 함께 신칸센을 탈 것도 있고, 하야토는여행을 매우 즐기고 있었다.그런데 갑자기 호쿠토 일의 전화가 걸려오고, 상황은 변한다...이렇게 신칸센 변형로보 신카리온이 시작된다.