나루토, 시카마루, 사쿠라는 임무 중에 수수께끼의 남자 테무진과 만나 교전하다 나루토와 테무진은 절벽에서 떨어져 버린다.
두 사람이 눈뜬곳은 어느 한 캐러밴, 테무진은 전쟁이 없는세상을 만들기 위해 게렐의돌 광맥을 찾고 있었으며.
나루토를 동료로 삼기위해 그의 수장인 [하이드]와 만나게 한다.

한편, 바람의나라가 수수께끼의 군단에 습격당했다는 소식이 들리고.
적의 잔해를 조사하던중 이들을 습격한 무리가 테무과 그의 동료인 하이드 일당임을 알게된 나루토,
분노한 나루토는 모래 닌자들과 함께 테무진 일당과 교전하게 된다.
그들이 말하는 이상향이란? 하이드의 진짜 목적은? 게렐의돌이 가진 힘은?
환상의 지하유적 에서 이들의 대격돌이 시작된다.