제1차 성간대전 80년 이후인 2090년대 태양계의 목성 궤도상에 이성인의 미확인 함대가 디폴드해온다.
지구통합군은 적을 젠트라디 함대라 인식해 오퍼레이션 민메이<민메이 디펜스>를 발동해 전투에 임한다.
그러나 적은 노래를 가지고 젠트라디를 이용해 전투하는 새로운 이성인이었다. 민메이 디펜스는 무너지고 통합군은 패배한다.
그러나 기자 칸자키 히비키와 적의 이뮬레이터였던 이슈탈, 통합군 대위인 실비 지나의 활약으로 적의 이뮬레이터들이
전쟁의 노래를 거부하며 반란을 일으켜 통합군과 함께 모함과 잉구스를 격추시켜 승리하게 된다. 그 후 인류와 마르두크는 영구평화조약을 체결하게 된다.