헤이안시대(794-1185) 바둑 교사였던 후지와라노 사이는
바둑을 너무도 좋아하는 사람이었으나 다른 바둑 교사의 음해로 인해
불명예스럽게 쫒겨난 후 그 울분을 삭이지 못하고 자살을 한다.
그러나 죽어서도 바둑에 대한 사랑이 식지 않은 그는
혼령이 되어 어느 한 바둑판으로 스며든다.
그후 그는 전설적인 바둑의 명문가문인 본인방의 소년에게 붙어
그를 최고의 기사가 되게 한 전력도 있다.
그러나 인간은 태어나면 죽는 법, 결국 명콤비였던 슈우샤쿠가 죽은 후
후지와라노 사이는 다시 영면에 든다.
그렇게 오랜 세월이 흘러 그는 히카루라는, 바둑에는 관심조차 없는
초등학교 6학년짜리 아이로 인해 다시 잠에서 깨어나게 된다.
"신의 한 수"라는 최고의 경지를 목표로 하는 사이는 이 아이를 졸라
기원에 가게 해서라도 바둑을 하고 싶어한다.
사이 때문에 얼떨결에 가게된 기원이지만, 점점 대국을 하면서
바둑의 묘미에 빠져 나가기 시작한다.
여기에 당대의 천재 기사 토우야 아키라와의 만남을 계기로 하여
스토리는 점점 더 흥미를 더하는데..