여름대회에서 고시엔을 앞둔 결승전에서의 통한의 패배를 겪은 세이도 고등학교 야구부.
그 동안 든든하게 지켜줬던 3학년생들의 졸업과 신 캡틴 미유키 카즈야를 중심으로 한 신팀의 개시가 이뤄지기 시작한다.
여름방학이 끝나고 단풍이 물드는 계절과 함께 열리는 가을대회가 세이도에 찾아온다.
가을대회의 우승팀은 3월에 있을 봄 고시엔에 참가가 가능하기에 카타오카 감독님을 붙잡기 위해서라도
그리고 여름의 치욕을 갚기 위해서라도 세이도 야구부는 가을대회의 우승을 노리며 힘차게 달려나간다.
그러나 첫 경기의 상대는 동도쿄의 여름 고시엔 출전 팀인 테이토 고등학교,
과연 세이도 야구부는 가을의 승리를 따낼 수 있을 것인가?